From dmfswiki
Whatsapp is an IM client for Android and iOS.
Issues
Für Kontakte die über CardDav Sync synchronisiert werden, oder auf dem Gerät in einem CardDav Sync Konto gespeichtert sind, legt WhatsApp keine Verbindung an. Das heisst, in der Kontakte App ist nicht zu sehen, dass der Kontakt bei WhatsApp ist, und es können keine Chats aus der Kontakte App gestartet werden. In WhatsApp selbst erscheint der Kontakt jedoch. Wir gehen davon aus, dass WhatsApp die Verbindungen nur für bekannte Kontotypen erstellt und das bei CardDav Sync überspringt. Wir haben keinen Einfluss darauf, das liegt einfach an der Implementierung von WhatsApp. (Getestet wurde das auf einem Sony Xperia Z3 Compact Android 4.4 Stock Rom)